Informácie

Čo definuje mikrobiálny druh?

Čo definuje mikrobiálny druh?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Viem, že mikróby nie sú schopné pohlavného rozmnožovania, takže triedenie do druhov podľa „skupín, ktoré sa môžu krížiť a vytvárať plodné potomstvo“, by nemalo platiť.


Vaša otázka sa týka konceptu druhov, ktorý používate. Mayrov koncept biologických druhov (BSC) je založený na schopnosti kríženia; definícia založená na procese. Väčšina biológov to používa, ale väčšina taxonómov, ktorí sú ľuďmi, ktorí skutočne opisujú druhy, používa určitú variáciu konceptu fylogenetického druhu. Fylogenetický koncept druhov nie je založený na procese, ale na pevných rozdieloch. Pevné rozdiely sú dôkazom nedostatku kríženia, ale tento koncept nie je výslovne založený na reprodukcii. Na klasifikáciu mikróbov sa použili pevné morfologické rozdiely, najčastejšie v kultúre. V súčasnosti sú však mikróby najčastejšie klasifikované kombináciou morfologických a genetických znakov. Malá podjednotka rRNA je sekvenovaná a podrobená algoritmu na odhadovanie druhov na základe genetických vzdialeností. Stručne povedané, vaša otázka veľa závisí od konceptu druhu, ktorý používate, a od toho, či by ste prijali definíciu DNA založenú na vzdialenosti. Druhy však netreba definovať reprodukčne.


Táto otázka v skutočnosti nemá jednoduchú odpoveď. Ako bolo uvedené v predchádzajúcej odpovedi, gén 16S rRNA používa veľa vedcov. Keďže ide o pomerne konzervovanú genetickú oblasť, mutácie v tejto oblasti môžu fylogeneticky diferencovať druhy, ale nie je to spoľahlivá metóda. Napríklad niekoľko druhov Shigella môže poskytnúť takmer identické 16S sekvencie ako tie Escherichia coli a zúria diskusie o tom, či by v skutočnosti mali byť klasifikované ako rovnaký druh. Niektorí vedci dokonca popierajú, že by existovali také veci, ako sú mikrobiálne druhy, alebo ak áno, že schopnosť zoskupovať mikróby do taxonomických jednotiek nestojí za to ani za informatívne (hoci títo vedci sú stále v menšine). Ak by ste sa chceli dozvedieť viac o tomto uhle pohľadu, môžete si pozrieť prácu W.F. Doolittle. Toto je zábavné čítanie:

Doolittle, W. a Zhaxybayeva, O. (2009). O pôvode prokaryotických druhov. Genome Research, 19(5), 744-756. http://dx.doi.org/10.1101/gr.086645.108