Informácie

Ako nájsť úplný mitochondriálny genóm rastlín v GenBank?

Ako nájsť úplný mitochondriálny genóm rastlín v GenBank?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Hľadám úplný mitochondriálny genóm druhuMalvaceaerodina. Aby som bol konkrétnejší, potrebujem rod Corchorus. Ale v génovej banke sa mi nepodarilo nájsť miesto, kde je. Po hľadaní v google som našiel toto, ale tu som nenašiel nič pre rastlinu.

Môžete mi pomôcť nájsť jeho skutočnú polohu?

Vedecká klasifikácia z Wikipédie:

Kráľovstvo: Plantae
(nezaradené): Krytosemenné rastliny
(nezaradené): Eudicots
(nezaradený): Rosids
Poradie: Malvales
Čeľaď: Malvaceae
Podčeľaď: Grewioideae
Rod: Corchorus L.


Keď hľadáte genóm Corchorus na Genbank nájdete len genómy vírusu, ktorý s ním súvisí. Nie je k dispozícii veľa rastlinných genómov a pre tie, ktoré nájdete, je dosť často prípad, že je tam zostavený len chloroplast.

Takže bohužiaľ najpravdepodobnejšia odpoveď na vašu otázku je: Pre túto rastlinu ešte nie je k dispozícii. Existuje len veľmi málo zásahov pre Malvales vôbec a zdá sa, že ani jeden z nich nemá mitochondrium zostavené.

Môže existovať šanca, že existuje konkrétny projekt/databáza pre Malvales alebo mitochondrie, kde by ste mohli hľadať, ale o žiadnom neviem.


je toto? http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/38606?genome_assembly_id=233326

Urobil som Google: „hľadaj mitochondriálny genóm BLAST“

a klikol na prvú stránku pre mňa „Zdroje genómu organel“. Potom som si vybral

„Prehľadávať podľa organizmov“ na ľavej strane, čím som sa dostal na novú stránku.

Potom som do ľavého horného textového poľa zadal frázu „Malvaceae“ a z textového poľa s výberom textového poľa sa objavil rolovací zoznam.

Vybral som si prvé "Malvaceae (taxid:3629)" a po kliknutí naň sa objavilo 26 záznamov pre organely. Dva z nich boli z Mitochondrií v stĺpci „Typ“.

Druhá položka je: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/10704?genome_assembly_id=233221

Prepáčte, ak som bol úplne mimo, som len vysokoškolák.


Pozri si video: GenBank (August 2022).